Jede Arbeitsgemeinschaft bearbeitet bestimmte Themenschwerpunkte federführend für das gesamte Gebiet der EUREGIO EGRENSIS (Beschluss des Gemeinsamen Präsidiums vom 08.03.2005):
- Sprachoffensive (EUREGIO EGRENSIS Arbeitsgemeinschaft Bayern)
- Verkehr und Infrastruktur (EUREGIO EGRENSIS Arbeitsgemeinschaft Sachsen/Thüringen)
- Kur- und Bäderwesen, Tourismus (EUREGIO EGRENSIS Arbeitsgemeinschaft Böhmen)